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애플리케이션 노트

연구 슬라이드 스캐너를 사용한 간 조직의 간경변 식별


서론

간경화증이라고도 하는 간경변증은 간이 장기간 손상되어 제대로 기능하지 못하는 상태입니다.이런 손상은 정상 간 조직이 반흔 조직으로 대체되는 것이 특징입니다.일반적으로 이 병은 수개월 또는 수년에 걸쳐 천천히 진행됩니다.초기에는 증상이 없는 경우가 많습니다.

간경변증은 일반적으로 알코올, B형 간염, C형 간염 및 비알코올성 지방간 질환에 의해 발생합니다.

진단 요인은 간 조직 내부의 콜라겐 섬유의 양입니다.특수 염색 방법을 사용해서 이런 섬유를 강조 표시하여 이미지 분석을 할 수 있습니다.

실험

마우스 간 생검을 취하여 유리 슬라이드 위에 고정시켰습니다.그 다음, 조직을 Picro-Sirius-Red & Fast-Green 염색제로 염색하여 섬유증 조직을 강조 표시했습니다.

Picro-Sirius-Red & Fast-Green 염색제는 Pico Sirius Red 염색제의 일종으로, 주변 조직을 Fast Green으로 대조 염색하여 빨간색으로 염색된 콜라겐 섬유를 더 돋보이게 합니다.

조직학의 다양한 진단 영역에서는 Sirius Red 염색을 사용하여 암, 혈관 또는 대사성 병리에 의해 유발되는 수많은 염증 사례의 섬유증 수준을 관찰합니다.

명시야 현미경을 사용하여 다음을 관찰할 수 있습니다.

• 노란색 핵 • 노란색 근섬유

• 노란색의 세포질 • 노란색의 적혈구

• 빨간색의 콜라겐 섬유


0.95 NA의 40x UPlanXApo 대물 렌즈를 사용하고, 40x 배율의 Olympus SLIDEVIEW™ VS200 연구 슬라이드 스캐너로 스테인드 슬라이드를 이미지화하여 최상의 해상도(0.17μm/픽셀)를 얻었습니다.

0.95 NA의 40x UPlanXApo 대물 렌즈를 사용하고, 40x 배율의 Olympus SLIDEVIEW™ VS200 연구 슬라이드 스캐너로 스테인드 슬라이드를 이미지화하여 최상의 해상도(0.17μm/픽셀)를 얻었습니다.

마우스 간 조직.두께: 4μm, 염색: Picro-Sirius-Red & Fast-Green(작업: Medizinische Universität Wien, Innere Medizin III, HEPEX Labor für Portale Hypertension und Fibrose bei Lebererkrankungen, Austria)

마우스 간 조직.두께: 4μm, 염색: Picro-Sirius-Red & Fast-Green(작업: Medizinische Universität Wien, Innere Medizin III, HEPEX Labor für Portale Hypertension und Fibrose bei Lebererkrankungen, Austria)
 

그러나 40x UPlanXApo 대물 렌즈의 초점 심도는 0.82μm에 불과합니다.간 조직 절편이 얇기 때문에(약 4μm), EFI(Extended Focal Imaging) 알고리즘을 적용하면 초점 면에서도 이미지 품질이 향상됩니다.

EFI를 사용하면 거의 무제한의 초점 심도를 가진 이미지를 얻을 수 있습니다.이를 위해 소프트웨어는 초점이 다른 여러 이미지를 사용하여 모든 영역이 선명한 합성 이미지를 계산합니다.

이미지 획득 프로세스에서는 먼저 Z 스택을 획득한 후 Z 스택에서 EFI 이미지를 계산합니다.

아래 그림은 다양한 Z 위치에서 획득한 여러 프레임을 보여줍니다.이런 각 프레임에는 선명하게 초점이 맞춰진 몇 개의 이미지 세그먼트만 있습니다.이런 세그먼트는 컬러로 표시되며, 선명하게 초점이 맞춰진 이미지 세그먼트들이 EFI 이미지로 조합됩니다.

EFI 이미지

빨간색으로 염색된 섬유증(콜라겐 섬유) 조직을 검출하기 위해 VS200-ASW 데스크톱 소프트웨어와 함께 VS200-Detect 솔루션을 사용했습니다.

VS200으로 캡처한 것과 같은 컬러 이미지를 이진 이미지로 변환하여 섬유 또는 배경을 검출하려면 각 픽셀의 색조, 채도 및 값을 사용하여 이미지의 임곗값을 정해야 합니다.

HSV를 사용하면 픽셀의 색상뿐 아니라 색상의 강도와 밝기를 기준으로도 필터링할 수 있습니다.

수동 HSV 임곗값을 2개 상에 적용함: 섬유증 조직의 경우 노란색, 다른 모든 조직의 경우 파란색.

수동 HSV 임곗값

수동 HSV 임곗값

HSV는 다음을 의미합니다.
색조: 픽셀의 색상을 측정합니다.
채도: 픽셀 색의 강도를 측정합니다.
값: 픽셀의 밝기를 측정합니다.

마우스 간 조직: (a) 원본 이미지, (b) 녹색으로 염색된 조직의 수동 임곗값 설정(파란색), (c) 빨간색으로 염색된 섬유의 수동 임곗값 설정(노란색) 및 (d) 2개 상의 결합 임곗값

마우스 간 조직: (a) 원본 이미지, (b) 녹색으로 염색된 조직의 수동 임곗값 설정(파란색), (c) 빨간색으로 염색된 섬유의 수동 임곗값 설정(노란색) 및 (d) 2개 상의 결합 임곗값
 

다음으로, 층별 계산 및 측정 절차는 다음과 같은 결과를 보여주었습니다. 전체 마우스 간 생검의 3.29%(노란색 막대)가 섬유증 조직에 대해 양성으로 염색되었습니다.

층별 계산 및 측정 절차의 결과: 전체 마우스 간 생검의 3.29%(노란색 막대)가 섬유증 조직에 대해 양성으로 염색되었습니다.

층별 계산 및 측정 절차의 결과: 전체 마우스 간 생검의 3.29%(노란색 막대)가 섬유증 조직에 대해 양성으로 염색되었습니다.


전체 마우스 간 절편에서 분석을 수행할 수 있습니다.

전체 마우스 간 절편에서 분석을 수행할 수 있습니다.
 

이 애플리케이션에 사용되는 제품

리서치 슬라이드 스캐너

VS200

VS200 연구 슬라이드 스캐너는 뇌, 암, 줄기 세포 및 신약 개발 연구를 비롯하여 대량의 샘플에 대한 정량 분석이 필요한 응용 부문의 연구 속도와 효율을 향상합니다. 고해상도 및 고품질 슬라이드 이미지를 쉽고 빠르게 확보하고 데이터를 쉽게 분석, 공유 및 기록할 수 있습니다. VS200 시스템은 명시야, 형광, 암시야, 위상차 및 단순 편광이라는 다섯 가지 이미지화 모드를 제공합니다. 자동 스캐닝 시 한 번에 최대 210개의 슬라이드를 로드할 수 있습니다.

  • 2X에서 100X까지 고해상도 전체 슬라이드 이미지화
  • 다양한 크기의 슬라이드 및 관찰 방법 수용
  • 명시야에서 형광 다중화에 이르는 간단하고 강력한 워크플로
  • 수동 명시야 스캐닝에서 AI 인식 및 완전 자동 스캐닝에 이르기까지 소프트웨어 및 하드웨어에서 고유하게 구성 가능

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