Il est devenu pour nous une tradition annuelle de partager les histoires de nos gagnants du concours « Global Image of the Year » (IOTY) en commençant par les trois gagnants régionaux et en terminant avec le gagnant mondial. Jusqu’à présent, pour le concours de 2021, nous avons dressé le portrait d’Ivan Radin, le gagnant pour les Amériques.
Pour l’Europe, le Moyen-Orient et l’Afrique (région EMEA), l’image gagnante appartient à Vasilis Kokkoris, un mycologue/écologiste des Pays-Bas. Lisez la suite pour en savoir plus sur cette image et sur les travaux de recherche qui ont mené Vasislis à la création de celle-ci.
Vasilis Kokkoris, gagnant de notre concours « Global Image of the Year » (IOTY) pour la région EMEA, avec un microscope CX23
Q. : Que montre votre image gagnante ?
Vasilis : L’image montre trois spores (les formations circulaires) d’un groupe fongique particulier connu sous le nom de champignons mycorhiziens arbusculaires (MA). Chaque point lumineux et coloré dans les spores correspond à un seul noyau. Les lignes plus abstraites derrière les spores représentent le corps filamenteux du champignon. Ces structures sont connues sous le nom d’hyphes et ressemblent à des tuyaux ouverts où les nutriments, l’eau et les organites se déplacent à une vitesse impressionnante sur de longues distances.
Q. : Qu’est-ce qui vous intéresse le plus à propos du sujet de votre image ?
Vasilis : Ce qui est unique à propos de ces spores, c’est que contrairement à la plupart des cellules qui ont généralement un ou deux noyaux, ces cellules (ou spores) comprennent des centaines de noyaux et font partie des cellules les plus multinucléées de notre planète. Je trouve fascinant le fait que nous puissions voir la quantité massive d’ADN, organisé dans les noyaux, que chaque spore contient.
Q. : Pouvez-vous nous en dire un peu plus sur votre poste actuel et sur le travail que vous faites ?
Vasilis : Je suis actuellement professeur assistant à la Vrije Universiteit (VU) Amsterdam, qui fait partie de l’Amsterdam Institute for Life and Environment (A-LIFE). La microscopie est d’une importance cruciale dans le cadre de mes recherches. Je l’utilise pour visualiser et quantifier les traits des champignons et pour percer les secrets génétiques des champignons.
Mes recherches visent une meilleure compréhension de la signification évolutive de ces champignons du sol (champignons MA) et de leur organisation et dynamique nucléaires uniques. J’aimerais que les connaissances acquises au moyen de ces recherches soient utilisées pour le développement d’une agriculture plus durable et qu’elles nous aident à mieux comprendre les défis auxquels la symbiose mycorhizienne est confrontée face aux changements climatiques. Pour en savoir plus, visitez mon site Web : www.vasilis-kokkoris.com/.
Q. : Quel type d’outils d’imagerie utilisez-vous dans le cadre de votre travail ?
Vasilis : J’utilise plusieurs méthodes pour étudier les champignons mycorhiziens. J’aime explorer des outils non traditionnels qui ne sont pas destinés à être utilisés pour la recherche sur les champignons, mais qui peuvent fournir des informations précieuses lorsqu’ils sont employés dans mon domaine (mycologie et écologie). Par exemple, dans un projet récent (Kokkoris et al., 2019), j’ai utilisé des outils de cartographie neuronale pour quantifier la croissance des hyphes des champignons mycorhiziens. Dans un autre projet (Kokkoris, Hart, 2019), j’ai utilisé des outils qui examinent la morphologie des racines pour quantifier la présence de champignons mycorhiziens à l’intérieur des racines. J’utilise également des types de microscopie plus avancés (microscopie confocale, microscopie électronique à balayage et microscopie électronique en transmission) pour examiner l’organisation nucléaire des champignons MA ainsi que l’architecture de leurs spores (Kokkoris et al., 2020, 2021).
À gauche : Image d’une spore mycorhizienne prise avec un microscope électronique à balayage.
À droite : Le champignon mycorhizien (bleu foncé) colonise les cellules racinaires des plantes (bleu transparent) et
forme des structures spécialisées appelées « arbuscules ». Ces structures arborescentes sont le lieu d’échange de
ressources entre les deux partenaires (la plante et le champignon).
Q. : À quel moment vous est venue l’idée d’utiliser des microscopes pour faire de l’art ?
Vasilis : Ma passion pour la microscopie a commencé à 12 ans lorsque mes parents m’ont offert mon premier microscope. Ce n’était peut-être qu’un jouet, mais il pouvait quand même grossir les échantillons jusqu’à 40 fois. Je me souviens encore d’avoir ramassé tout ce que je pouvais trouver dans notre jardin qui pouvait tenir entre l’objectif et la platine et de l’avoir examiné au microscope. Cela m’a ouvert les yeux sur un monde fascinant, auparavant invisible, et a fait naître ma passion pour la biologie.
La microphotographie a été une composante importante de mon parcours universitaire. Je prends des photographies au microscope depuis de nombreuses années, essayant d’utiliser ces photographies pour extraire des données utiles et tirer des conclusions scientifiques. En même temps, je consacre toujours du temps à prendre des images qui, en plus d’être scientifiquement utiles, ont aussi une valeur artistique.
Q. : Souhaitez-vous ajouter autre chose ?
Vasilis : Si vous souhaitez en savoir plus sur les réseaux fongiques, leur fonction et leur importance, je vous invite à vous rendre au https://spun.earth/, le site de la Society for the Protection of Underground Networks (SPUN), un groupe auquel je suis associé et dont je suis un collaborateur principal. La SPUN est une initiative scientifique à but non lucratif fondée pour cartographier les réseaux de champignons mycorhiziens et pour promouvoir leur protection.
Références
Inscriptions au concours IOTY 2022
Si vous souhaitez participer au concours « Global Image of the Year » de 2022, rendez-vous sur notre page IOTY pour soumettre votre candidature.
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