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Descripción
Estación de cribado modular de alto contenido para las ciencias de la vidaLa plataforma modular de procesamiento de imágenes scanR, basada en una configuración de sistemas microscópicos, permite la adquisición de imágenes y el análisis de datos de muestras biológicas de forma totalmente automatizada gracias a la tecnología de aprendizaje profundo (Deep Learning). |
Potente visualización de datos para análisis interactivosEl sistema scanR destaca en el análisis y la evaluación de datos, ya sea fuera de línea o paralelamente a la adquisición de datos. El sistema, mediante el uso de técnicas IA y de aprendizaje profundo, detecta objetos como células o núcleos sin intervención del usuario. El potente análisis citométrico de datos se adapta a las demandas específicas destinadas a analizar un alto número de células. Los enlaces bidireccionales provenientes desde todos los puntos de datos y curvas de tiempo hasta las galerías celulares y datos de imagen permiten comprender sus muestras desde el nivel de célula única hasta las populaciones de millones de células; además, cada dato es remontable hasta la imagen original. El sistema facilita la configuración de ensayos cuantitativos fiables en pocos minutos. |
Flujo de trabajo rápido y automatizado para el cribado de alto contenidoLa estación de cribado scanR combina la modularidad y flexibilidad de una configuración microscópica dotada de las capacidades de automatización, rapidez y rendimiento necesarias para un cribado de alto contenido. El flexible diseño del sistema permite cumplir los requisitos del procesamiento de imágenes cuantitativas y análisis de imágenes en biología celular, biología molecular, biología de sistemas e investigación médica en la actualidad.
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Detección de objetos y mejoramiento de imágenes asistidos por la tecnologíaTruAINuestra innovadora capacidad analítica, proporcionada a través de la tecnología TruAI™, le permite implementar más ensayos fácilmente. Esta valiosa tecnología de aprendizaje reduce el fotoblanqueo y mejora la velocidad de adquisición, la sensibilidad de las mediciones y la exactitud, lo que favorece observaciones más prolongadas con menor influencia en la viabilidad de las células. Las redes de segmentación TruAI favorecen una segmentación y clasificación sólidas en muestras complejas, poco o nada sensibles a los artefactos o con fluctuaciones o señales de fondo intensas. Las redes de mejoramiento TruAI generan imágenes claras a partir de aquellas dotas de un fuerte ruido, o eliminan señales desenfocadas.
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Necesidades cubiertas de muchos ensayosEl análisis basado en el ensayo ejecutado con el sistema scanR es reproducible y fiable, lo que lo hace apto a integrar su flujo de trabajo. Con resultados instantáneos paralelamente a la adquisición, los ensayos pueden ser personalizados y adaptados a un amplio rango de aplicaciones. El sistema destaca en las aplicaciones de descubrimiento de fármacos, mostrando los efectos bioquímicos de los compuestos a nivel celular y los cambios inducidos por fármacos en los niveles de expresión genética. La solución puede medir apoptosis, micronúcleos o fragmentación del ADN (ensayos comet) y cubre una amplia gama de aplicaciones de cribado:
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Hardware flexible y modularLa estación de cribado scanR combina la modularidad y flexibilidad de una configuración microscópica dotada de las capacidades de automatización, rapidez y rendimiento necesarias para un cribado de alto contenido. El diseño modular está pensado para ensayos estándar y desarrollo de ensayos, y hace que la estación scanR sea adaptable a las aplicaciones de desarrollo de los laboratorios o entornos multiusuario. |
Sistema confocal de disco giratorio
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Sistema robótico de carga
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Sistema de incubación
| Sistema TIRF y FRAP (con el software cellSens)
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¿Necesita ayuda? |
Tecnologías aplicadas
Control por puertas y clasificación
| Un enfoque controlado por puertas de nivel jerárquico permite seleccionar de forma intuitiva partes de datos que pueden ser visualizadas en galerías. |
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Microscopía de autoaprendizajeLa microscopía de autoaprendizaje abre nuevos horizontes en el cribado de alto contenido. Las aplicaciones van desde las tareas de segmentación y clasificación de imágenes —que antes eran imposibles—, hasta el análisis cuantitativo de niveles de señal extremadamente bajos, la simplificación de los protocolos de tinción, el análisis sin marcado y mucho más. |
Ejemplo de un proceso de trabajo usando la microscopía de autoaprendizaje para generar un modelo por inteligencia artificial para el análisis sin marcado de imágenes complejas en campo claro. Los núcleos celulares de las células de HeLa están marcados con GFP para la fase de formación a fin de mostrar al sistema cómo analizar las imágenes de campo claro. | Ejemplo de aplicación: Segmentación firme de los núcleos celulares bajo diferentes niveles de señal, lo que permite una reducción radical de la exposición a la luz para el análisis cuantitativo. |
Videos asociadosEl usuario posee completo control sobre el diseño del experimento de formación. | Videos asociadosDurante la fase de formación es posible cubrir muchas condiciones de análisis desafiantes. | Videos asociadosEl protocolo analítico aprendido por la inteligencia artificial puede ser validado de forma exhaustiva y fácil a través de la interfaz de análisis y exploración de datos exclusiva del software. |
Inicio rápidoLos modelos de redes neuronales preformados e incluidos le permiten empezar a usar la IA de forma rápida. Con el uso de modelos preformados, puede empezar a detectar el núcleo y las células en la mayoría de condiciones estándar. Incluso las células confluentes y los núcleos densos pueden distinguirse con fiabilidad. Las medidas de control y validación se encuentran integradas al sistema para poder garantizar la precisión y la fiabilidad de los resultados de análisis por la inteligencia artificial (IA). |
Segmentación precisa de objetos: datos sin procesar/tratar (izq.), segmentación de umbral estándar (centro), segmentación de instancias TruAI (dcha.). La segmentación de instancias separa de forma fiable los objetos difíciles de distinguir que están situados muy cerca entre sí, tales como células o núcleos en colonias o tejidos. |
Detalle en imagen capturada después de la adquisición de datos mediante el sistema scanR que demuestra la detección y la separación del marcado. Cortesía de la Dra. R. Peperkok, EMBL, Heidelberg, Alemania. | Detección y análisis de objetos
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Control de calidad instantáneoLas imágenes y los objetos están vinculados recíprocamente a sus puntos de datos respectivos:
Cree una vista de galería de todas las imágenes o la población de datos limitada a fin de comparar de forma visual y directa los conjuntos de imágenes más grandes con información relevante. | Los resultados son visualizados a partir de mapas térmicos o pueden ser exportados a tablas. Se ofrece una descripción general de todos los pocillos llenos. |
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Videos asociados | Adquisición multinivelDespués de un escaneo preliminar inicial, el software de análisis scanR permite identificar todos los objetos potenciales de interés. A través de un proceso de trabajo automatizado, los resultados son usados para escanear los objetos de interés de forma selectiva en una segunda pantalla específica. |
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Medición de los parámetros cinéticos con el módulo cinético
| Células de hES expresadas en un biosensor de FUCC (CA). Cortesía de la Dra. Silvia Santos, The Francis Crick Institute, Londres, Reino Unido. |
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Procesamiento de imágenes de alto nivel combinado con un análisis de alto contenido
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Opciones flexibles del móduloLa solución scanR no solo satisface los requisitos específicos de velocidad, resistencia y fiabilidad de un sistema de cribado de alto contenido completamente automatizado, sino que también ofrece niveles incomparables de flexibilidad y adaptabilidad con numerosas opciones de expansión. Esto permite que el sistema scanR cumpla las especificaciones de una gama más amplia de aplicaciones y presupuestos. Añada módulos con las siguientes capacidades a su sistema:
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¿Necesita ayuda? |
Especificaciones
Sistema de cribado scanR | Plataforma del sistema de cribado de base microscópica para aplicaciones de ciencias de la vida. |
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Flexibilidad: La configuración del sistema se adapta a las necesidades de la aplicación. | |
Rendimiento y resistencia: El sistema integrado y la sincronización en tiempo real combinan las ventajas de una plataforma abierta y las exigencias aplicativas de cribado en cuanto a rendimiento y fiabilidad. | |
Estativo del microscopio | Microscopio invertido IX83 de Evident con uno o dos bancos. |
Opciones de iluminación LED | Motor de luz SPECTRA X de Lumencor con seis canales LED independientes (nueva versión de 2023 soportada) |
Sistema de iluminación de la serie max pe400 de CoolLED con cuatro canales LED independientes | |
Sistema de iluminación de la serie ultra pe300 de CoolLED con tres canales LED independientes. | |
Filtro de paso de banda optimizados para la aplicación. | |
LED o lámpara halógena | |
Opciones de iluminación de luz transmitida | Opciones de transmisión, contraste de fase y DIC |
Combinación de la fluorescencia y transmisión con un rápido obturador de transmisión (HF202HTde Prior con controlador Proscan III) | |
Control de hardware para la sincronización de láser en sistemas CSU | Control de USB-6343 de National Instruments para la salida digital (ocho canales) y la salida analógica (cuatro canales). |
Opciones de cámara | ORCA-Flash 4.0, V3, de Hamamatsu —cámara de alta sensibilidad con tecnología sCMOS de color enfriado (cooled) y gran chip sensor de 18,8 mm (0,74 pulg.). Chip de sensor |
ORCA-Flash 4.0 LT de Hamamatsu —cámara económica con tecnología sCMOS y gran chip sensor de 18,8 mm (0,74 pulg.). Chip de sensor | |
ORCA-Fusion de Hamamatsu —cámara con tecnología sCMOS y gran chip sensor de 21,2 mm (0,83 pulg.). Chip de sensor | |
ORCA-Fusion de Hamamatsu —cámara con tecnología sCMOS de ruido ultra bajo y gran chip sensor de 21,2 mm (0,83 pulg.). Chip de sensor | |
Opciones de objetivos (soporta los objetivos X Line) | Objetivos para sustratos «finos» (de 0,1 mm a 0,2 mm [de 0,004 pulg. a 0,008 pulg.]), cubreobjetos y placas de fondo de vidrio (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X). |
Objetivos para sustratos «gruesos» (~1 mm [0,04 pulg.]), placas de fondo de plástico y platinas (2X, 4X, 10X, 20X, 40X, 60X, 100X). | |
Objetivos de contraste de fase para sustratos «finos» (de 0,1 mm a 0,2 mm [de 0,004 pulg. a 0,008 pulg.]), cubreobjetos y placas de fondo de vidrio (10X, 20X, 40X). | |
Objetivos de contraste de fase para sustratos «gruesos» (~1 mm [0,04 pulg.]), cubreobjetos y placas de fondo de vidrio (10X, 20X, 40X). | |
Conjuntos de filtros | Conjuntos de filtros unibanda (especificaciones según pedido) |
Conjuntos de filtros multibanda (especificaciones según pedido) | |
Software de sistema scanR | Dos módulos de software independientes: software de adquisición scanR y software de análisis scanR. |
Análisis que pueden ejecutarse en paralelo a la adquisición | |
Módulos de software que pueden instalarse en la misma estación de trabajo u otra diferente (Windows 10 o 11 de 64 bits) | |
Software de adquisición scanR | Configuración orientada al flujo de trabajo e interfaz de usuario |
Procedimientos de autoenfoque variables y potentes del software, que pueden combinarse con una función opcional de autoenfoque del hardware de láser IR, autoenfoque grueso y fino de dos pasos, autoenfoque basado en objetos o autoenfoque basado en imágenes. | |
Administrador de placas flexibles con formatos predefinidos (platinas, placas multipocillos) e interfaz de edición para crear y modificar formatos personalizados (matrices marcadas). | |
Corrección del sombreado para compensar el sombreado y optimizar la homogeneidad de la intensidad espacial. | |
Cribado en intervalos, cribado con apilamiento en Z, cribado multicolor (número ilimitado de canales de adquisición). | |
Respaldo en cuanto a la integración en líneas automatizadas de preparación de muestras (p.ej., interfaces programables para la manipulación de líquidos). | |
Software de análisis scanR | Puede ser ejecutado en paralelo a la adquisición. |
Plantillas de ensayo disponibles para las aplicaciones clásicas (recuento, ciclo celular, expresión del marcador único y doble, traslocación, detección de punto). | |
Generador de ensayo para configurar su propio ensayo | |
Procesamiento de imágenes, detección de objetos y subobjetos, selección y cálculo de parámetros. | |
Exploración, análisis, control por puertas y clasificación de datos citométricos. | |
Concepto de control por puertas potente y flexible con análisis de población celular. | |
Enlace directo entre puntos de datos, objetos e imágenes. | |
PC | PC de procesamiento de imágenes (digitalizador) de última generación, con Windows 10 o 11 de 64 bits y unidad de procesamiento gráfico NVIDEA para una rápida digitalización de imágenes por IA. |
Opciones adicionales | Solución de aprendizaje profundo (Deep-learning) por IA del scanR: forme y aplique la segmentación celular en función de la IA. |
Módulo de análisis cinético en intervalo: método único para la monitorización celular y la clasificación citométrica basada en las dinámicas celulares. | |
Módulo de deconvolución 3D: [Aceleración de unidad de procesamiento gráfico soportada]. | |
Rueda de filtros de emisión rápida para el procesamiento de imágenes a alta velocidad (HF110 o HF108 de Prior con el controlador ProscanIII). | |
Opción de unidad confocal CSU-W1 de Yokogawa con una o dos cámaras (adquisición simultánea). | |
Sistema de incubación | |
Robot de carga (cargador) de placas de hasta 40 placas en un solo escaneo. | |
Modificador de magnificación codificado IX3-CAS | |
Estación de trabajo de análisis scanR adicional | |
Visor de análisis scanR | |
Segunda licencia para el software de análisis scanR | |
Configuración del sistema 2 en 1 | Puede ser combinada con el software de procesamiento de imágenes de células vivas cellSens para disfrutar de la versatilidad completa del sistema de procesamiento de imágenes. |