Startseite/ WhitepaperMehr Effizienz bei der Vorbereitung zum Mikroskopieren mit dem intelligenten APX100 Probennavigator

Mehr Effizienz bei der Vorbereitung zum Mikroskopieren mit dem intelligenten APX100 Probennavigator

Einführung

Mikroskopische Untersuchungen sind ein wichtiger Bestandteil der biowissenschaftlichen und medizinischen Forschung. Mikroskope ermöglichen die Untersuchung von Mikrobereichen in hoher Auflösung. Allerdings ist das Sehfeld begrenzt, so dass nur schwer zu erkennen ist, welcher Teil der Probe gerade betrachtet wird. Bei der Betrachtung einer Probe mit einem Mikroskop, das mit Okularen ausgestattet ist, muss die Probe zunächst visuell in den optischen Strahlengang des Mikroskops gebracht werden. Anschließend blickt der Benutzer durch die Okulare und führt eine detaillierte Suche durch, um die zu untersuchende Stelle zu bestimmen. All diese Aufgaben müssen bereits im Vorfeld der Mikroskopuntersuchung stattfinden. Besonders dann, wenn der Benutzer mit der Bedienung des Mikroskops nicht vertraut ist, können diese Arbeitsgänge langsam sein und viele Wiederholungen erfordern.

Der intelligente Probennavigator des APEXVIEW APX100 Fluoreszenzmikroskop als Tischgerät führt die folgenden Aufgaben automatisch aus und trägt dazu bei, die Vorbereitung zu beschleunigen:

Aufnahme eines Makrobilds, um ein vollständiges Bild der Probe zu erhalten
Ausrichtung der Proben für die direkte Untersuchung
Initialisierung der Einstellung der Fokusposition je nach Gefäß

APX100

Abbildung 1

Abbildung 1: Arbeitsablauf mit dem APX100 ist effizienter als bei einem herkömmlichen Mikroskop.

Makro-Aufnahmen

Makroaufnahmen, die das Gesamtbild der Probe erfassen, haben den Vorteil, dass die zu untersuchende Stelle schnell gefunden werden kann. Dank der einzigartigen Weitwinkel-Makrooptik des APX100 Systems wird im ersten Schritt schnell ein Makrobild der Probe erzeugt.

Makrooptiken zur Aufnahme von Weitwinkelaufnahmen sind häufig nicht telezentrisch. Das bedeutet, dass bei einer Makroaufnahme einer Well-Platte die Form des Wells am Sehfeldrand verzerrt ist. Insbesondere spiegelt sich die Wandoberfläche in dem Makrobild, so dass der Boden des Wells nur schwer zu erkennen ist. Damit die Wells im Sehfeld nicht verzerrt dargestellt werden, kann ein engeres Sehfeld verwendet werden. Dazu müssen jedoch für jedes Well mehrere Bilder aufgenommen und zu einem Makrobild zusammengefügt werden.

Um diese Einschränkungen zu beseitigen, verwendet das APX100 System ein Objektiv mit großer Blende für die Makrooptik (Abbildung 2) und erreicht so eine gute Telezentrizität und ein großes Sehfeld. Die Vergrößerung der Makrooptik beträgt etwa 0,07X, und die Aufnahme eines Makrobildes einer Probe im Probenhalter ist mit nur zwei Schnappschüssen erledigt.

Abbildung 2

Abbildung 2: Überblick über die Makrooptik des APX100 Systems.

Probenerkennung

Die Probenerkennung des intelligenten Probennavigators basiert auf KI (Deep Learning). Die Probe wird im Makrobild automatisch lokalisiert, wenn der Probenhalter für Glasobjektträger verwendet wird. Der Objekttisch bewegt sich dann so, dass sich die Probe im mikrooptischen Strahlengang befindet. Zudem passt der Probennavigator die Höhe der Objektive an, so dass der Benutzer sofort mit der detaillierten Untersuchung beginnen kann.

Die Analyse der Probe mithilfe der KI gliedert sich in zwei Phasen: Lernen und Inferenz. Für Inferenzen muss die KI zunächst anhand einer Reihe von Lernbildern trainiert werden. Zu diesem Zweck nutzt die Probenerkennungsfunktion des intelligenten Probennavigators ein neuronales Netz, das bereits mit vielen Probentypen trainiert ist. Neben HE-gefärbten Gewebeproben sind auch achromatische Gewebeproben, z. B. mit Fluoreszenzfarbstoffen gefärbte Hirngewebeschnitte von Labormäusen, und die Deckglasverwendung in der Identifizierungsklasse enthalten.

Die Inferenz wird durchgeführt, wenn das aufgenommene Makrobild in das trainierte KI-Netz eingegeben wird (Abbildung 3), um das Gewebe und das Deckglas auf den untersuchten Objektträgern zu erkennen. Als Hilfestellung für den Benutzer während der Bildgebungsexperimente zeigt das System die Ergebnisse der Probenerkennung grün umrandet an (Abbildung 3).

Abbildung 3

Abbildung 3: KI-Erkennungsnetz des APX100 Systems und die Ergebnisse der Probenerkennung.

Unterstützung bei der Untersuchung

Die folgenden Funktionen des intelligenten Probennavigators erleichtern das Mikroskopieren mit noch mehr:

Bestimmung der Beobachtungsposition auf dem angezeigten Makrobild und schnelle Einnahme dieser Beobachtungsposition (Abbildung 4).
Erfassung hochauflösender Übersichtsbilder anhand der Ergebnisse der Probenerkennung (Abbildung 5).
Kennzeichnung von Bereichen, in denen es während der Untersuchung zu Kollisionen mit Probenhaltern kommen könnte (Abbildung 6).

Abbildung 4

Abbildung 4: Benutzeroberfläche der cellSens APEX Software.

Abbildung 5

Abbildung 5: Festlegung des Bereichs für die Übersichtsbildaufnahme anhand der Ergebnisse der Probenerkennung.

Abbildung 6

Abbildung 6: Software zeigt Bereiche an, in denen es zur Kollision mit dem Probenhalter kommen kann.

Zusammenfassung

Der intelligente Probennavigator des APX100 Systems macht die Arbeitsgänge vor dem Mikroskopieren effizienter. Der intelligente Probennavigator bewegt den Objekttisch, um die Probe zu finden, stellt die Höhe der Objektive ein und sucht die zu untersuchende Stelle. All diese Schritte, die bisher manuell durchzuführen waren, erfolgen nun automatisch und deutlich effizienter.

Mit nur einem Klick findet der intelligente Probennavigator die Probe, bewegt sie in den optischen Strahlengang für die Untersuchung unter dem Mikroskop und stellt die Höhe der Objektive ein. Der gesamte Prozess dauert nur etwa zehn Sekunden. Mit dem aufgenommenen Makrobild kann die zu untersuchende Stelle sofort überprüft und der Objekttisch schnell in die richtige Position gebracht werden, um direkt mit der Betrachtung zu beginnen.